日本国内国立感染症研究所以“超过死亡”概念为基础，从1999年起进行了被称为“流感相关死亡迅速掌握系统”的独自调查。但由于该系统专用于调查流感影响，因此无法直接用来调查新冠病毒影响。

国立感染症研究所一直运用“流感相关死亡迅速掌握系统”来把握因流感而造成的超过死亡。每年冬季到春季从全国21个城市的保健所听取流感或者肺炎至死的每周人数报告，并在评价有否“超过死亡”基础上将其结果公开于网站。

尽管如此，该公开信息中有一项“实际死亡数”的图形，但与词汇表现“实际死亡数”不相符的是这一数值并非实际从保健所获得的死者数汇报，而是统一除了“2.24”进行了补正后的数字。

一般来说，推测统计“超过死亡”一项时，与死亡原因无关而要使用所有的死亡者数的，但研究所表示由于是专用评价流感，因此其对象仅限定于肺炎或者流感，因此用除以2.24进行了补正。但上述这种经过数值补正的消息事实上并没有公开。

对此，研究所此次表示，“所有地区都统一用“2.24”来除，这的确存在一定的不确切性。同时，以往将经过补正的死亡者数作为“实际死亡者数”进行记录公开，这一做法也存在问题，应该得以改善”。